O genoma mitocondrial de Neophysopella tropicalis (2025)
- Authors:
- Autor USP: SOUZA, MAURICIO JAMPANI DE - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- DOI: 10.11606/003258173
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; DNA MITOCONDRIAL; FERRUGEM (DOENÇA DE PLANTA); FUNGOS FITOPATOGÊNICOS; GENOMAS; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; UVA
- Language: Português
- Abstract: A ferrugem da videira é uma doença causada por espécies do gênero Neophysopella, recentemente reorganizado a partir do gênero Phakopsora. No Brasil, ocorrem duas espécies: N. meliosma-myriantha, na região Nordeste, e N. tropicalis, nas regiões Sul e Sudeste. Ambas não possuem o genoma mitocondrial completamente caracterizado, o que limita estudos funcionais e investigações sobre a regulação gênica no contexto da interação planta-patógeno. Essa lacuna, em conjunto com o aquecimento global e com o uso exacerbado de fungicidas, que pode desencadear o desenvolvimento de resistência química, contribui para a necessidade da elucidação do mitogenoma dessas espécies. Neste trabalho, objetivou-se a montagem e anotação de novo do mitogenoma de N. tropicalis, a partir do sequenciamento por long reads (Oxford Nanopore) em conjunto com dados do transcriptoma do fungo para validação da anotação. O genoma mitocondrial obtido apresenta 61.070 pares de bases, contendo os 14 genes essenciais, 24 RNAs transportadoras e quatro ORFs identificadas nas regiões intrônicas do gene cox 1. A caracterização do mitogenoma de N. tropicalis oferece uma base sólida para estudos futuros sobre a regulação dos genes mitocondriais durante a infecção do fungo e amplia a quantidade de dados disponíveis para a consolidação da árvore filogenética das ferrugens
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2025
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo NÃO é de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: closed
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ABNT
SOUZA, Mauricio Jampani de. O genoma mitocondrial de Neophysopella tropicalis. 2025. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2025. Disponível em: https://doi.org/10.11606/003258173. Acesso em: 03 jan. 2026. -
APA
Souza, M. J. de. (2025). O genoma mitocondrial de Neophysopella tropicalis (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://doi.org/10.11606/003258173 -
NLM
Souza MJ de. O genoma mitocondrial de Neophysopella tropicalis [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 03 ] Available from: https://doi.org/10.11606/003258173 -
Vancouver
Souza MJ de. O genoma mitocondrial de Neophysopella tropicalis [Internet]. 2025 ;[citado 2026 jan. 03 ] Available from: https://doi.org/10.11606/003258173
Informações sobre o DOI: 10.11606/003258173 (Fonte: oaDOI API)
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