Um modelo estocástico da regulação gênica no operon lac (2024)
- Authors:
- Autor USP: SANTOS, RAYSSA OLIVEIRA - IME
- Unidade: IME
- Sigla do Departamento: MAP
- Subjects: EXPRESSÃO GÊNICA; REGULAÇÃO GÊNICA; ESCHERICHIA COLI; ALGORITMOS; MODELOS MATEMÁTICOS
- Keywords: Operon lac; Modelagem estocástica; Algoritmo de Gillespie; lac operon; Stochastic modelling; Gillespie’s algorithm
- Language: Português
- Abstract: Este trabalho aplica um modelo estocástico da regulação gênica no operon lac de E. coli e busca verificar sua capacidade em descrever o comportamento do sistema em comparação com a abordagem determinística de cinética clássica. O modelo estocástico utilizado foi formulado por Stamatakis e Mantzaris (2009) e simulado com uma implementação própria do algoritmo de Gillespie. A modelagem determinística foi realizada com base nas equações de taxa de reação. Ambas as abordagens consideraram apenas o mecanismo de repressão mediado pelo repressor LacI, com o IPTG utilizado como indutor. A comparação entre as abordagens determinística e estocástica destacou a importância de se considerar a estocasticidade no operon lac. A modelagem determinística fornece uma descrição contínua da dinâmica do sistema e não leva em conta as flutuações moleculares, que podem ser significativas quando o número de moléculas é pequeno. Por outro lado, a modelagem estocástica considera essas flutuações e é capaz de capturar ativações transientes do operon lac, em que o repressor LacI se dissocia momentaneamente do operador, permitindo a transcrição de LacY em intervalos não regulares. Conclui-se que a modelagem estocástica pode fornecer uma visão adicional e mais detalhada do comportamento do operon lac, especialmente em condições de baixa concentração de IPTG, onde as flutuações moleculares podem influenciar significativamente o sistema.
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ABNT
SANTOS, Rayssa Oliveira. Um modelo estocástico da regulação gênica no operon lac. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Instituto de Matemática e Estatística, Universidade de São Paulo, São Paulo, 2024. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/b4353dde-f08f-4670-bbdc-b21db4dc5fe6/3241300.pdf. Acesso em: 30 abr. 2025. -
APA
Santos, R. O. (2024). Um modelo estocástico da regulação gênica no operon lac (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Instituto de Matemática e Estatística, Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/b4353dde-f08f-4670-bbdc-b21db4dc5fe6/3241300.pdf -
NLM
Santos RO. Um modelo estocástico da regulação gênica no operon lac [Internet]. 2024 ;[citado 2025 abr. 30 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/b4353dde-f08f-4670-bbdc-b21db4dc5fe6/3241300.pdf -
Vancouver
Santos RO. Um modelo estocástico da regulação gênica no operon lac [Internet]. 2024 ;[citado 2025 abr. 30 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/b4353dde-f08f-4670-bbdc-b21db4dc5fe6/3241300.pdf
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