Estudo do mecanismo de ativação e inativação da RAB7A por simulações de dinamica molecular (2022)
- Authors:
- Autor USP: SUN, SARAH SANDY - FMRP
- Unidade: FMRP
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; DOENÇA DE ALZHEIMER; PROTEÍNAS; SIMULAÇÃO
- Keywords: Pequenas GTPases; Structural bioinformatics; Small GTPases; Alzheimer's disease
- Language: Português
- Abstract: A doença de Alzheimer (DA) é uma enfermidade genética neurodegenerativa multifatorial associada ao envelhecimento. Devido aos impactos econômicos e sociais, a DA é uma preocupação global pois até o momento é clinicamente não atendida totalmente. Muitas hipóteses tentam explicar a etiologia complexa dessa doença, sendo a cascata amilóide e da hiperfosforilação da proteína Tau as hipóteses mais estudadas. Embora não haja um consenso sobre a etiologia da DA, pesquisadores vêm mostrando interesse pela patologia Tau por ter uma maior relação com o declínio cognitivo. Dentre diversos alvos enzimáticos estudados na tentativa de descobrir novos medicamentos para o tratamento da DA; no entanto, as RAB GTPases são relativamente inexploradas. A RAB7A é uma pequena GTPase que regula os processos celulares por meio da alternância entre os nucleotídeos GDP e GTP. Estudos têm demonstrado que essa enzima é regulada positivamente em portadores de Alzheimer, proporcionando altos níveis de proteína Tau. Sendo assim, a modulação da atividade de RAB7A pode representar uma estratégia promissora para o tratamento da DA. Dessa forma, o trabalho realizado conta com a preparação das estruturas da proteína e nucleotídeos GDP/GTP, análise de interações dos complexos proteína-ligante e a dinâmica molecular (DM). Os complexos RAB_GDP e RAB_GTP foram submetidos a simulações de DM a fim de investigar as variações conformacionais ao longo do tempo e a flexibilidade nas regiões switch da proteína. Foi encontrado diferenças na flexibilidade da região switch 1 ao comparar os estados ativo e inativo, podendo concluir que quando a RAB7A está complexada ao GTP, o sistema alcançou mais estabilidade. Assim, supondo que possa ser usada como um alvo eficaz para a procura de possíveis inibidores contra a RAB7A e consequentemente para o tratamento da DA
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2022
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ABNT
SUN, Sarah Sandy. Estudo do mecanismo de ativação e inativação da RAB7A por simulações de dinamica molecular. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2022. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/cfd2cb03-dc9c-4094-a024-b4cca7ab5477/TCC%20SarahSun.pdf. Acesso em: 22 mar. 2025. -
APA
Sun, S. S. (2022). Estudo do mecanismo de ativação e inativação da RAB7A por simulações de dinamica molecular (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/cfd2cb03-dc9c-4094-a024-b4cca7ab5477/TCC%20SarahSun.pdf -
NLM
Sun SS. Estudo do mecanismo de ativação e inativação da RAB7A por simulações de dinamica molecular [Internet]. 2022 ;[citado 2025 mar. 22 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/cfd2cb03-dc9c-4094-a024-b4cca7ab5477/TCC%20SarahSun.pdf -
Vancouver
Sun SS. Estudo do mecanismo de ativação e inativação da RAB7A por simulações de dinamica molecular [Internet]. 2022 ;[citado 2025 mar. 22 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/cfd2cb03-dc9c-4094-a024-b4cca7ab5477/TCC%20SarahSun.pdf
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