Identificação de elementos cis-reguladores (CREs) nos promotores de genes co-expressos em cana-de-açúcar (2022)
- Authors:
- USP affiliated author: NOVOLETTI, JOÃO VITOR LEITE - ESALQ
- School: ESALQ
- Subjects: ALELOS; CANA-DE-AÇÚCAR; EXPRESSÃO GÊNICA; GENÔMICA; REGULAÇÃO GÊNICA
- Keywords: Cis-reguladores
- Language: Português
- Abstract: A cana-de-açúcar é uma planta de grande importância econômica para o país, sendo uma das principais culturas no valor da produção agrícola, justificando estudos que visam aumento em sua produção. O entendimento da regulação de seus genes pode gerar base para essa finalidade. Esse trabalho se propôs em avaliar elementos cis-reguladores (CREs) em promotores de genes co-expressos na folha de cana-de-açúcar, através da busca “de novo” de motivos e comparação com um banco de dados de elementos cis-reguladores (JASPAR), a fim de entender os fatores que atuam na regulação da transcrição desses genes. Houve a identificação de 2579 motivos que foram comparados entre si, agrupados por sua similaridade e comparados contra o JASPAR. Dessa comparação, 98 motivos obtiveram semelhança com os sítios de ligação de fatores de transcrição (FT) conhecidos. Em seguida, foi realizado análise dos FTs resultantes conforme sua família e outras subclassificações para inferência de informação funcional dos motivos. Foram identificados sítios de ligação com FTs pertencentes à várias famílias, dentre elas, AP2/ERF, MADS-Box, DOF, Myb-related, BBR/BPC, TCP, GRF, que apresentam funções no desenvolvimento, morfologia e resposta ao estresse. Concluiu-se que a estratégia de avaliação de motivos em genes co-expressos foi eficaz na avaliação de CREs em cana-de-açúcar, apesar de que não houve comprovação de especificidade de expressão a “clusters” determinados por meio da ferramenta utilizada. Além disso, foi apontada a necessidade da realização de estudos acerca de elementos cis-reguladores presentes em monocotiledôneas, objetivando ampliar a gama de dados disponíveis para comparação
- Imprenta:
- Place of publication: Piracicaba
- Date published: 2022
-
ABNT
NOVOLETTI, João Vitor Leite. Identificação de elementos cis-reguladores (CREs) nos promotores de genes co-expressos em cana-de-açúcar. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2022. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/21794408-3c12-43da-9d2b-579178b681c3/TCCJoaoVitorLeiteNovoletti.pdf. Acesso em: 23 abr. 2024. -
APA
Novoletti, J. V. L. (2022). Identificação de elementos cis-reguladores (CREs) nos promotores de genes co-expressos em cana-de-açúcar (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/21794408-3c12-43da-9d2b-579178b681c3/TCCJoaoVitorLeiteNovoletti.pdf -
NLM
Novoletti JVL. Identificação de elementos cis-reguladores (CREs) nos promotores de genes co-expressos em cana-de-açúcar [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/21794408-3c12-43da-9d2b-579178b681c3/TCCJoaoVitorLeiteNovoletti.pdf -
Vancouver
Novoletti JVL. Identificação de elementos cis-reguladores (CREs) nos promotores de genes co-expressos em cana-de-açúcar [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 23 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/21794408-3c12-43da-9d2b-579178b681c3/TCCJoaoVitorLeiteNovoletti.pdf
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