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Trabalho de conclusao de curso - tcc

Análise in silico de metabólitos secundários de isolados bacterianos (2022)

  • Authors:
  • USP affiliated author: MARUYAMA, ISABELA AKEMI - FMRP
  • School: FMRP
  • Subjects: BIOINFORMÁTICA; COMPOSTOS ORGÂNICOS; GENÔMICA; GENOMAS
  • Keywords: Genomic analysis; Secondary metabolites; Bioinformatic; In silico
  • Language: Português
  • Abstract: Os estudos de análise genômica estão focados em diversos microrganismos em busca de vias biossintéticas que produzam moléculas bioativas com aplicações biotecnológicas, como por exemplo: na agricultura visando os bioagentes e microrganismos multifuncionais, e na saúde com a busca constante de novos possíveis antibióticos. Neste trabalho, foram realizadas a identificação in silico e a predição de vias biossintéticas de metabólitos secundários do genoma de duas amostras de bactérias isoladas do solo de Sertãozinho: a Priestia megaterium (MAPA1) e a Arthrobacter sp. (M4). Para isso utilizou-se as ferramentas de bioinformática antiSMASH, deepBCG e o KEGG. Com a ferramenta antiSMASH foram identificados na Priestia megaterium e Arthrobacter sp. 9 e 5 regiões com cluster gênico de metabólitos secundários, respectivamente. Já com a ferramenta deepBCG foram encontrados 46 clusters na Priestia megaterium sendo 2% relacionados com função citotóxica, 59% antibacteriana e 39% não determinada e 62 clusters na Arthrobacter sp. sendo 1% com função citotóxica, 2% inibitória, 72% antibacteriana e 25% não determinada. Por fim, com a ferramenta KEGG foram analisadas as rotas metabólicas e foram encontradas 25 rotas na Priestia megaterium e 49 rotas na Arthrobacter sp., porém as amostras apresentaram apenas 1-2 genes presentes em cada uma das rotas. Então, embora as ferramentas apresentem os resultados citados, não são todas as regiões encontradas que possuem clusters com alta similaridade com o banco de dados, as rotas identificadas possuem poucos genes presentes, e as ferramentas possuem resultados divergentes entre si. Portanto, a análise in silico auxilia quanto ao gerenciamento do tempo e diminuição dos custos de pesquisas in vitro para detectar produtos naturais, pois com as predições das análises de bioinformática é possível fazer uma melhor escolha da amostra. Com isso, após as análises temos um melhor parâmetro paraescolher quais espécies passarão por uma análise manual com experimentos in vitro para a validação dos resultados encontrados
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    Versão Publicada ISABELA AKEMI MARUYAMA - ... Direct link
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    • ABNT

      MARUYAMA, Isabela Akemi. Análise in silico de metabólitos secundários de isolados bacterianos. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2022. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/09b411e4-6f48-4fc6-bbbb-b1a5c00f416e/ISABELA%20AKEMI%20MARUYAMA%20-%20AN%C3%81LISE%20IN%20SILICO%20DE%20METAB%C3%93LITOS%20SECUND%C3%81RIOS%20DE%20ISOLADOS%20BACTERIANOS.pdf. Acesso em: 19 abr. 2024.

    • APA

      Maruyama, I. A. (2022). Análise in silico de metabólitos secundários de isolados bacterianos (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/09b411e4-6f48-4fc6-bbbb-b1a5c00f416e/ISABELA%20AKEMI%20MARUYAMA%20-%20AN%C3%81LISE%20IN%20SILICO%20DE%20METAB%C3%93LITOS%20SECUND%C3%81RIOS%20DE%20ISOLADOS%20BACTERIANOS.pdf

    • NLM

      Maruyama IA. Análise in silico de metabólitos secundários de isolados bacterianos [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/09b411e4-6f48-4fc6-bbbb-b1a5c00f416e/ISABELA%20AKEMI%20MARUYAMA%20-%20AN%C3%81LISE%20IN%20SILICO%20DE%20METAB%C3%93LITOS%20SECUND%C3%81RIOS%20DE%20ISOLADOS%20BACTERIANOS.pdf

    • Vancouver

      Maruyama IA. Análise in silico de metabólitos secundários de isolados bacterianos [Internet]. 2022 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/09b411e4-6f48-4fc6-bbbb-b1a5c00f416e/ISABELA%20AKEMI%20MARUYAMA%20-%20AN%C3%81LISE%20IN%20SILICO%20DE%20METAB%C3%93LITOS%20SECUND%C3%81RIOS%20DE%20ISOLADOS%20BACTERIANOS.pdf

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