Planejamento de inibidores da cruzaína de Trypanosoma Cruzi, pela aplicação de técnicas computacionais (2021)
- Authors:
- USP affiliated author: GONÇALVES, RAFAEL BELLO - FCF
- School: FCF
- Subjects: DOENÇA DE CHAGAS; TRYPANOSOMA CRUZI
- Keywords: cruzaína; Planejamento de inibidores
- Language: Português
- Abstract: INTRODUÇÃO: A doença de Chagas é uma parasitose causada pelo parasita Trypanosoma cruzi, atinge cerca de 6 milhões de pessoas em todo o mundo. Essa doença anteriormente endêmica na américa latina, devido à processos de globalização, atualmente apresenta uma distribuição mundial. Identificada e caracterizada em 1909 por Carlos Chagas, até hoje não existe um tratamento eficaz para a fase crônica da infecção. Existem apenas dois fármacos disponíveis (benzonidazol e nifurtimox) ambos com sérios efeitos adversos e com ação quase que somente na fase aguda da doença e, além disso, já foram reportadas cepas do parasita resistentes a eles. Diante deste contexto, se faz necessário a descoberta de novos agentes quimioterápicos seguros e eficazes. A cruzaína, principal cisteína protease produzida do T. cruzi, se apresenta como um excelente alvo terapêutico na busca de fármacos antichagásicos, visto que tem importante papel na invasão de células do hospedeiro, na replicação, diferenciação e no metabolismo do parasito. OBJETIVO: Construção de modelos de relação quantitativa entre estrutura química e atividade biológica (Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR)) para compostos inibidores da cruzaína, capazes de predizer a atividade biológica e auxiliar na descoberta de novos inibidores. MATERIAL E MÉTODOS: Partindo de uma série de inibidores da cruzaína extraídos da literatura, os quais foram separados em conjuntos treino e teste foram empregados nos estudos de QSAR. Para construção dos modelos de QSAR 2D foram utilizados descritores moleculares gerados no software Padel. Sua análise e construção dos modelos foram feitos na plataforma KNIME. A seleção dos descritores foi feita por Principal Component Analysis (PCA), e manualmente, por correlação linear, para comparação. Sete modelos deregressão foram obtidos para o modelo QSAR 2D. Para o estudo de QSAR 3D, os ligantes tiveram sua geometria otimizada no programa Gaussian, usando o método SemiEmpírico PM6. Para o alinhamento molecular, foi usado o processo de docagem no programa GOLD. No programa SYBYL foram construídos modelos de Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) e Comparative Molecular Similarity Indices Analysis (CoMSIA). RESULTADOS: Dentre os modelos obtidos por QSAR 2D, os que apresentaram melhor resultado foram os de Random Forest (R² = 0,949 e q² = 0,620), Tree Ensemble (R² = 0,950 e q² = 0,613). Os melhores modelos obtidos por QSAR 3D foram o CoMFA (R² = 0,830 e q² = 0,712) e CoMSIA (R² = 0,929 e q² = 0,701). CONCLUSÃO: Foram criados 4 modelos com robustez satisfatória para predição de novos inibidores de cruzaína, sendo que os modelos 2D tem a vantagem de serem mais simples, exigirem menos recursos, e usarem inteiramente softwares gratuitos
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ABNT
GONÇALVES, Rafael Bello. Planejamento de inibidores da cruzaína de Trypanosoma Cruzi, pela aplicação de técnicas computacionais. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Universidade de São Paulo, São Paulo, 2021. Disponível em: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3fb6bc37-84a8-4695-903e-6fbf8de5d215/3066921.pdf. Acesso em: 26 abr. 2024. -
APA
Gonçalves, R. B. (2021). Planejamento de inibidores da cruzaína de Trypanosoma Cruzi, pela aplicação de técnicas computacionais (Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação). Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3fb6bc37-84a8-4695-903e-6fbf8de5d215/3066921.pdf -
NLM
Gonçalves RB. Planejamento de inibidores da cruzaína de Trypanosoma Cruzi, pela aplicação de técnicas computacionais [Internet]. 2021 ;[citado 2024 abr. 26 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3fb6bc37-84a8-4695-903e-6fbf8de5d215/3066921.pdf -
Vancouver
Gonçalves RB. Planejamento de inibidores da cruzaína de Trypanosoma Cruzi, pela aplicação de técnicas computacionais [Internet]. 2021 ;[citado 2024 abr. 26 ] Available from: https://bdta.abcd.usp.br/directbitstream/3fb6bc37-84a8-4695-903e-6fbf8de5d215/3066921.pdf
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